В марте 1954 г. директива "JANAP-146" была переиздана с индексом "с". Теперь в ней указывалось, что данные о всех неизвестных объектах, включая НЛО, должны передаваться как сообщения первостепенной важности и, если они касаются наблюдений в воздухе, то в начале донесения должно ставиться условное обозначение "CIRVIS", а если на море, то индекс "MERINT" . При этом подчеркивалось, что донесения с такими обозначениями содержат информацию, касающуюся национальной обороны, и разглашение их содержания любым путем запрещается и карается законом о шпионаже. Характерно также, что в приложении к этой директиве давался пример передачи по радиотелеграфу сообщения именно об НЛО, которое выглядело следующим образом: "MERINT 5125 14 230. 3 неопознанных летающих объекта курсом на норд-вест, высота 17 000 футов, форма сигары 50 футов, в 2 милях. Проверено штурманом, видимость неограниченная. 211 513 Джонс".

После выхода этой директивы в 1954 г. пилотам гражданских авиалиний также было запрещено разглашать сведения о наблюдениях ими НЛО. В марте 1966 г. Комитетом начальников штабов был издан пятый вариант директивы "JANAP-146" с индексом "е" , в котором указывалось, что НЛО должны рассматриваться в числе вражеских целей, приближающихся к Соединенным Штатам и Канаде, и подробно перечислялись данные, которые должны были содержаться в каждом донесении о наблюдениях НЛО. Штабом ВВС был издан целый ряд секретных документов специально по НЛО. Первым из них была секретная инструкция "AFR 200-2" , разработанная в августе 1953 г., согласно которой исследование НЛО сосредоточивалось в трех организациях: - разведуправлении ВВС в Пентагоне; - 4602-й эскадрилье научного обеспечения, имевшей своих представителей на всех авиабазах; - научно-техническом центре ВВС на базе Райт-Паттерсон. При этом даже высшим офицерам ВВС запрещалось пытаться добывать из этих организаций какие-либо сведения об НЛО или зондировать результаты первой стадии исследований.

А все подлинные сообщения объявлялись секретными и должны были направляться в соответствующие инстанции. Причем части летающих тарелок, а также фотографии экранов радаров, на которых показаны маневры и скорости летающих тарелок, или подлинные фотографии самих тарелок должны были немедленно направляться в Научно-технический центр ВВС.

В августе 1954 г. инструкция "AFR-200-2" была переиздана, и в ней дополнительно указано, что интерес ВВС к проблеме должен охватывать следующие аспекты: во-первых, возможную угрозу безопасности США; во-вторых, определение технических характеристик этих объектов, так как, по-видимому, на их основе могут быть созданы летательные аппараты принципиально новой конструкции. В инструкции подчеркивалось также, что все части ВВС в своих расследованиях случаев наблюдений НЛО не должны заходить дaльше того, что требует 4602-я эскадрилья научного обеспечения. Инструкция "AFR.-200-2" в сентябре 1959 г. была переиздана под заголовком "Операции и действия НЛО - дело серьезное". При этом в ней подчеркивалось, что командиры авиабаз могут выдавать прессе или общественности сведения о наблюдении летающего объекта только в случае, если он идентифицирован. А если наблюдение необъяснимо, то должны делаться уклончивые заявления о том, что оно перепроверяется и данные будут выданы позднее.

В сентябре 1966 г. инструкция "AFR-200-2" была заменена новой инструкцией "AFR.-80-17" , в которой всем командирам авиабаз предписывалось создать пункты наблюдения за НЛО и расследовать каждый случай их появления, чтобы установить, что же в действительности наблюдалось. В инструкции Штаба ВМС США "OPNAV...94-р-3" , изданной в июле 1959 г., капитанам торговых и рыболовецких судов тоже предписывалось давать немедленные донесения по радио с кодовой группой букв "MERINT" о приближении к Американскому континенту неизвестных ракет, НЛО, кораблей, подводных лодок и самолетов, а в приложении к инструкции были помещены изображения дискообразного и продолговатого НЛО. Известно также, что для ускорения опознавания НЛО на большинстве американских военных кораблей были помещены изображения основных типов НЛО. В справочнике американских ПВО тоже было помещено изображение НЛО в форме диска с огнями. Представляют определенный интерес и различные приказы американских властей, касающиеся перехвата и открытия огня по НЛО.